Открытие музея было приурочено к столетию основания в Киеве централизованной системы канализации в 1894 году. Среди экспонатов музея канализации керамические трубы, которым более 100 лет, фрагменты старых кирпичных канализационных колодцев, макет лыбедского коллектора в натуральную величину, схема канализационных сетей Киева, макет тренировочной площадки и многое другое.